ज्ञानवापी के व्यास जी तहखाने में हिंदुओं के पूजा के अधिकार को बहाल करने के वाराणसी जिला न्यायालय के आदेश के खिलाफ, मस्जिद व्यवस्था समिति ने तत्काल सुनवाई के लिए सुबह 3 बजे सुप्रीम कोर्ट का दरवाजा खटखटाया, लेकिन उन्हें निराशा हुई। सुप्रीम कोर्ट ने कहा कि अगर इतनी जल्दी है तो पहले हाई कोर्ट में अपील करें.
मस्जिद व्यवस्था समिति की कानूनी टीम ने बुधवार-गुरुवार की मध्यरात्रि को सुप्रीम कोर्ट रजिस्ट्रार के आवास से संपर्क किया, तत्काल सुनवाई का अनुरोध किया और मस्जिद के अंदर रात के समय की प्रार्थना के बारे में चिंता व्यक्त की। कुछ समय बाद, सुप्रीम कोर्ट के रजिस्ट्रार ने मस्जिद व्यवस्था समिति के एडवोकेट-ऑन-रिकॉर्ड फ़ुज़ैल अहमद अय्यूबी को मुख्य न्यायाधीश का संदेश दिया कि उन्हें इलाहाबाद उच्च न्यायालय का दरवाजा खटखटाना चाहिए।
मस्जिद इंतजामिया कमेटी ने अपनी अर्जेंट याचिका में दलील दी थी कि वाराणसी कोर्ट के आदेश के बाद प्रशासन त्वरित कार्रवाई कर रहा है. सुप्रीम कोर्ट रजिस्ट्री को तात्कालिकता से अवगत कराते हुए एक पत्र में, एडवोकेट-ऑन-रिकॉर्ड फ़ुज़ैल अहमद अय्यूबी द्वारा प्रतिनिधित्व की गई समिति ने लिखा है कि, ट्रायल कोर्ट के आदेश के अनुसार प्रशासन के पास रात के अंधेरे में इस कार्य में जल्दबाजी करने का कोई कारण नहीं है। उन्हें आवश्यक व्यवस्था करने के लिए पहले ही एक सप्ताह का समय दिया गया था। इस तरह की अनुचित जल्दबाजी का स्पष्ट कारण यह है कि प्रशासन वादी पक्ष के साथ मिलकर मस्जिद प्रबंधन समिति द्वारा उन्हें एक निश्चित उपलब्धि के साथ प्रस्तुत करके उक्त आदेश के खिलाफ उनके उपचार का लाभ उठाने के किसी भी प्रयास को रोकने की कोशिश कर रहा है।”
पिछले साल अगस्त में, सुप्रीम कोर्ट ने भारतीय पुरातत्व सर्वेक्षण (एएसआई) को मस्जिद परिसर (तथाकथित ‘वुज़ुखाना’ को छोड़कर जहां एक ‘शिवलिंग’ पाया गया था) का सर्वेक्षण करने की अनुमति दी थी। एएसआई सर्वेक्षण का उद्देश्य यह निर्धारित करना था कि क्या मस्जिद पहले से मौजूद हिंदू मंदिर संरचना पर बनाई गई थी। सर्वेक्षण रिपोर्ट को 24 जनवरी को वाराणसी अदालत द्वारा सार्वजनिक करने की अनुमति दी गई थी। एएसआई के निष्कर्षों ने ज्ञानवापी मस्जिद के निर्माण से पहले एक बड़े हिंदू मंदिर के अस्तित्व का संकेत दिया है। इस प्राचीन मंदिर के स्तंभों सहित इसके कुछ हिस्सों का मस्जिद में पुन: उपयोग किया गया। रिपोर्ट में तहखाने में दबे शिलालेखों, हिंदू देवताओं की मूर्तियों और वास्तुशिल्प संरचनाओं का भी पता चला। एएसआई रिपोर्ट में यह भी उल्लेख किया गया है कि संरचना को विकृत कर दिया गया है और मस्जिद के निर्माण और मरम्मत में इसका उपयोग किया गया है।